磷酸二氢钾用作高效磷钾复合肥料，适用于各种土壤和作物。也用作细菌培养剂合成清洒的调味剂，制偏磷酸钾的原料，酿造酵母的培养剂、强化剂、膨松剂、发酵助剂。医药上用于使尿酸化，作营养剂。食用级产品在食品工业用于制造烘焙物，味精、发酵粉。饲料级用作饮料营养.

在小麦等农作物上的施用：
一、施用时期土壤中磷、钾比较缺乏的沙土、壤质土，可在整地时底施磷酸二氢钾，播前用磷酸二氢钾溶液浸种，小麦分蘖高峰期、返青起身期、拔节期、孕穗期、灌浆期追施磷酸二氢钾，其中灌浆期必须施用。磷、钾含量较高的中壤和黏质土壤，可用磷酸二氢钾溶液进行浸种，并在返青拔节期、孕穗期、灌浆期追施。
二、施用浓度（一）基施。磷酸二氢钾做底肥，每亩以8～10公斤为宜，配合施用25公斤尿素，可达到氮、磷、钾配比平衡的目的。（二）浸种。每亩用磷酸二氢钾200克即可。（三）叶面喷洒。每亩每次施用300～700克，对水40～60公斤，喷洒浓度为0.8％～1％。
三、施用方法施底肥，应把磷酸二氢钾和细土拌匀后，在耕翻时均匀撒施，或将其与氮肥混匀后施，施后耙匀。浸种，应根据所需磷酸二氢钾用量对水搅匀，使容器中液面高出种子5厘米，浸种10小时，捞出晾干后即可播种。叶面喷洒，应在无风晴朗天气的上午10时前或下午4时后，把对好的磷酸二氢钾溶液均匀喷洒于叶面。