而丝藻的去除方法也比较简单，一般说来，如果丝藻不是多到影响视觉，或者堵住过滤口的情况下，是不必去除的，甚至还有高手专门培植丝藻，在水流冲击下，不打结的丝藻也是一景。当然如果去除丝藻的话，可以考虑使用牙刷在水草表面转动，丝藻就如同头发般自动被牙刷卷起扯掉。但是要注意动作一定要轻，以免伤害了莫丝活水草的表面。因为有的丝藻韧性很强大！如果就想用生物发去除丝藻，可以考虑米奇鱼、黑线飞狐、鳑鲏。这里要说的是，虽然这三种鱼都吃丝藻，但是有意思的是，在不同的人手里表现不太一样，每一种都有被反应不吃，或者吃的很好，所以要有这方面的心理准备。
化学去除：52几乎是很多顽固藻类的首选，以90的缸为例。丝藻泛滥的情况下，第一次换水4L，然后用4L的RO水兑2ml的50%的52（自来水的话量减半），第二天混水后再换4-6L水关灯爆氧。第三天水清之后，丝藻肉眼可见的少了，也不长了。第三天开始，52的量减半，RO换水兑1ml的50%的52，持续2天，丝藻不再长，以前泛滥的成一团团落在泥上。以后维持换水加0.5ml的50%的52即可。
