小叶罗汉松种实为核果状，近球形或卵圆形，成熟时肉质假种皮由翠绿色转黄绿色，充分成熟时变为紫黑色。种实着生于肥大肉质的种托上，种托肉质圆柱状，呈红色或紫红色，成熟后易脱落。每果内有种子1粒，种仁富含油脂，久藏易霉坏，丧失发芽率。种子粒重250-400克，发芽率60%-80%。

根据种子发芽试验的观测结果，种子的萌发，下胚轴先出土面，8-10日后，子叶带壳缓慢出土，幼苗出土10日后种壳脱落，子叶2片线形，子叶展开后2-4日发出真叶。初生叶8-10片密集生于梢头。幼苗地面部分全为绿色，根部黄白色，主根粗壮，初无侧根，1月后逐发侧根，侧根上密生瘤菌。2月左右木质化，此时生长速度较快。1年生苗木最高达80厘米以上，地径1厘米。采集的种子应及时脱去种托，以免霉坏。宜随采随播，如需贮藏或运输，将种子稍加晾干，使种皮皱缩，润沙贮运，不宜烈日曝晒和堆沤。圃地育苗宜选择排水良好，土质疏松的微酸性土壤，切忌积水。

播种前种子不需处理，直接播入圃地，宜用少量母树林下土壤，均匀拌种播下；也可先催芽待种皮破裂或种子萌动后，点播于事先准备好的营养杯中，营养土可用园土配适量经堆沤和消毒过的有机肥。种子发芽适宜温度为14℃左右。用条点直播法播种，条距30-35厘米，株距8-10厘米，点播营养杯可选12厘米-15厘米规格的营养杯（袋），条点播每公顷用种量为300千克左右。苗期注意施少量亚硫酸铁，防病并能促进苗木生长，早期生长缓慢，需适当遮荫，3个月后，苗木生长加快，可逐步增加光照。整个苗期采用一般性水肥管理，无需特别要求。